DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'MINOCYCLINE'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
2DRD_A_MIYA2001 2drd MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli ACRB PF00873
(ACR_tran)
9 GLN A 176
PHE A 178
GLY A 179
GLU A 273
ASN A 274
ILE A 277
ALA A 279
VAL A 612
PHE A 615
MIY A2001
2WQ5_A_MIYA1120 2wq5 MIY

DB01017
(Minocycline)
Naja naja PHOSPHOLIPASE A2,
ACIDIC
PF00068
(Phospholip_A2_1)
7 LEU A   2
TRP A  18
ALA A  22
GLY A  29
ARG A  30
PHE A  63
PHE A  64
MIY A1120
2XPV_A_MIYA1209 2xpv MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS D
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
13 HIS A  64
SER A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
THR A 112
VAL A 113
GLN A 116
LEU A 131
ILE A 134
SER A 138
MIY A1209
3AOD_A_MIYA2001 3aod MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
8 SER A  48
PHE A 178
GLY A 179
GLU A 273
ASN A 274
ILE A 277
ALA A 279
PHE A 615
MIY A2001
3V3N_A_MIYA2001 3v3n MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN PF01494
(FAD_binding_3)
11 GLN A 192
ARG A 213
MET A 215
PHE A 224
HIS A 234
GLY A 236
SER A 238
PRO A 318
PHE A 319
GLY A 321
ASN A 371
MIY A2001
3V3N_B_MIYB2001 3v3n MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 8 GLN B 192
ARG B 213
PHE B 224
HIS B 234
GLY B 236
GLY B 321
ASN B 371
MET B 375
MIY B2001
3V3N_C_MIYC2001 3v3n MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 8 GLN C 192
ARG C 213
PHE C 224
HIS C 234
GLY C 236
GLY C 321
ASN C 371
MET C 375
MIY C2001
3V3N_D_MIYD2001 3v3n MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 11 GLN D 192
ARG D 213
MET D 215
PHE D 224
HIS D 234
GLY D 236
SER D 238
PHE D 319
GLY D 321
ASN D 371
MET D 375
MIY D2001
4A99_A_MIYA391 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN PF01494
(FAD_binding_3)
10 GLN A 192
ARG A 213
MET A 215
PHE A 224
ASN A 226
HIS A 234
GLY A 236
SER A 238
GLY A 321
MET A 375
MIY A 391
4A99_A_MIYA392 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN PF01494
(FAD_binding_3)
no annotation
9 SER C  66
LYS A  72
LEU A  77
GLN A  78
TYR A  81
PHE A 110
GLN C 322
SER C 326
VAL C 329
MIY A 392
4A99_B_MIYB391 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 11 GLN B 192
ARG B 213
MET B 215
PHE B 224
ASN B 226
HIS B 234
GLY B 236
SER B 238
PRO B 318
GLY B 321
MET B 375
MIY B 391
4A99_C_MIYC391 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 11 ASN C 190
GLN C 192
ARG C 213
MET C 215
PHE C 224
ASN C 226
HIS C 234
GLY C 236
SER C 238
GLY C 321
MET C 375
MIY C 391
4A99_C_MIYC392 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN PF01494
(FAD_binding_3)
no annotation
12 LYS A  64
TYR A  81
PRO A 106
GLU A 107
ARG A 109
PHE A 110
VAL C 329
ILE C 333
GLN C 356
ILE C 359
TYR C 360
GLU C 363
MIY C 392
4A99_D_MIYD391 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 11 GLN D 192
ARG D 213
MET D 215
PHE D 224
ASN D 226
HIS D 234
GLY D 236
SER D 238
GLY D 321
ASN D 371
MET D 375
MIY D 391
4A99_D_MIYD392 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 5 HIS D  63
SER D  66
GLN D 322
SER D 326
VAL D 329
MIY D 392
4A99_D_MIYD393 4a99 MIY

DB01017
(Minocycline)
Bacteroides
thetaiotaomicron
TETX2 PROTEIN no annotation 5 ILE D 333
GLN D 356
ILE D 359
TYR D 360
GLU D 363
MIY D 393
4AC0_A_MIYA1204 4ac0 MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli TETRACYCLINE
REPRESSOR PROTEIN
CLASS B FROM
TRANSPOSON TN1 0
PF00440
(TetR_N)
PF02909
(TetR_C)
12 HIS A  64
PHE A  67
ASN A  82
PHE A  86
HIS A 100
ARG A 104
PRO A 105
GLN A 109
THR A 112
LEU A 113
GLN A 116
LEU A 131
MIY A1204
4DX5_B_MIYB1103 4dx5 MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 13 SER B  48
GLN B 151
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
MIY B1103
4U8V_B_MIYB1103 4u8v MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB
no annotation 14 GLN B 151
LEU B 177
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
PHE B 610
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
MIY B1103
4U8Y_B_MIYB1102 4u8y MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB
no annotation 12 PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
PHE B 610
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
MIY B1102
4U95_B_MIYB1102 4u95 MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT ACRB
no annotation 12 SER B  48
PHE B 178
GLY B 179
SER B 180
GLU B 273
ASN B 274
ASP B 276
ILE B 277
ALA B 279
VAL B 612
PHE B 615
ARG B 620
MIY B1102
5ENT_C_MIYC901 5ent MIY

DB01017
(Minocycline)
Escherichia coli MULTIDRUG EFFLUX
PUMP SUBUNIT
ACRB,MULTIDRUG
EFFLUX PUMP SUBUNIT
ACRB
no annotation 9 SER C  48
GLN C 176
PHE C 178
GLY C 179
SER C 180
GLU C 273
ASN C 274
ILE C 277
ALA C 279
MIY C 901