DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'GEMCITABINE'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1P62_B_GEOB302 1p62 GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Mus musculus DEOXYCYTIDINE KINASE PF01712
(dNK)
11 ILE B  30
GLU B  53
VAL B  55
TRP B  58
MET B  85
TYR B  86
GLN B  97
ARG B 128
ASP B 133
PHE B 137
GLU B 197
GEO B 302
2NO0_A_GEOA302 2no0 GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Homo sapiens DEOXYCYTIDINE KINASE PF01712
(dNK)
14 ILE A  30
GLU A  53
VAL A  55
TRP A  58
LEU A  82
MET A  85
TYR A  86
PHE A  96
GLN A  97
ARG A 128
ASP A 133
PHE A 137
ARG A 194
GLU A 197
GEO A 302
2NO0_B_GEOB302 2no0 GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Homo sapiens DEOXYCYTIDINE KINASE no annotation 14 ILE B  30
GLU B  53
VAL B  55
TRP B  58
LEU B  82
MET B  85
TYR B  86
PHE B  96
GLN B  97
ARG B 128
ASP B 133
PHE B 137
ARG B 194
GLU B 197
GEO B 302
2VPP_A_GEOA1210 2vpp GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Drosophila
melanogaster
DEOXYNUCLEOSIDE
KINASE
PF01712
(dNK)
13 ILE A  29
GLU A  52
VAL A  54
TRP A  57
MET A  69
TYR A  70
PHE A  80
GLN A  81
VAL A  84
ARG A 105
ALA A 110
PHE A 114
GLU A 172
GEO A1210
2VPP_B_GEOB1207 2vpp GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Drosophila
melanogaster
DEOXYNUCLEOSIDE
KINASE
no annotation 14 ILE B  29
GLU B  52
VAL B  54
TRP B  57
LEU B  66
MET B  69
TYR B  70
PHE B  80
GLN B  81
VAL B  84
ARG B 105
ALA B 110
PHE B 114
GLU B 172
GEO B1207
4PD5_A_GEOA501 4pd5 GEO

DB00441
(Gemcitabine)
Vibrio cholerae NUPC FAMILY PROTEIN PF01773
(Nucleos_tra2_N)
PF07662
(Nucleos_tra2_C)
PF07670
(Gate)
13 GLY A 153
GLN A 154
ALA A 185
VAL A 188
TYR A 192
LEU A 259
ASN A 331
GLU A 332
PHE A 333
PHE A 366
ASN A 368
SER A 371
ILE A 374
GEO A 501