DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'DOXORUBICIN'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1I1E_A_DM2A3001 1i1e DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Clostridium
botulinum
BOTULINUM NEUROTOXIN
TYPE B
PF01742
(Peptidase_M27)
PF07951
(Toxin_R_bind_C)
PF07952
(Toxin_trans)
PF07953
(Toxin_R_bind_N)
9 GLU A1188
GLU A1189
GLY A1238
HIS A1240
ARG A1241
CYS A1257
SER A1259
TRP A1261
TYR A1262
DM2 A3001
2DR6_A_DM2A2002 2dr6 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRB PF00873
(ACR_tran)
9 SER A  46
GLN A  89
SER A 134
GLN A 176
PHE A 178
GLY A 179
ILE A 277
PHE A 615
PHE A 617
DM2 A2002
4DX7_A_DM2A1105 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
11 MET A 575
PHE A 617
THR A 676
GLY A 679
ASP A 681
ARG A 717
ASN A 719
ARG A 815
GLU A 826
GLN A 830
MET A 862
DM2 A1105
4DX7_A_DM2A1106 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
PF00873
(ACR_tran)
11 SER A 134
MET A 575
PHE A 617
PHE A 664
PHE A 666
ASN A 667
LEU A 668
THR A 676
ALA A 677
ARG A 717
GLN A 830
DM2 A1106
4DX7_B_DM2B1104 4dx7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Escherichia coli ACRIFLAVINE
RESISTANCE PROTEIN B
no annotation 8 SER B  46
GLN B  89
GLU B 130
GLN B 176
PHE B 178
ILE B 277
VAL B 612
PHE B 615
DM2 B1104
4ZVM_A_DM2A303 4zvm DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens RIBOSYLDIHYDRONICOTI
NAMIDE DEHYDROGENASE
[QUINONE]
PF02525
(Flavodoxin_2)
no annotation
12 TRP A 105
GLN B 122
PHE B 126
ILE B 128
GLY A 149
GLY A 150
THR A 151
MET A 154
ASN A 161
PHE B 178
GLU A 193
ILE A 194
DM2 A 303
4ZVM_B_DM2B303 4zvm DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens RIBOSYLDIHYDRONICOTI
NAMIDE DEHYDROGENASE
[QUINONE]
PF02525
(Flavodoxin_2)
no annotation
11 VAL A  69
TRP B 105
GLN A 122
PHE A 126
GLY B 149
GLY B 150
MET B 154
ASN B 161
PHE A 178
GLU B 193
ILE B 194
DM2 B 303
5MRA_B_DM2B204 5mra DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens SORCIN no annotation 6 PHE B 134
THR B 170
ARG B 174
ASP B 177
GLY B 182
TYR A 188
DM2 B 204
5OM7_A_DM2A501 5om7 DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 11 VAL A  31
GLN A 242
ASN A 244
GLN A 270
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
DM2 A 501
6FTP_B_DM2B501 6ftp DM2

DB00445
(Epirubicin)
DB00997
(Doxorubicin)
Homo sapiens ALPHA-1-ANTICHYMOTRY
PSIN
no annotation 9 GLN A 242
LEU A 273
SER A 274
PHE A 277
GLU A 278
LEU A 280
VAL B 381
ASN B 383
TRP B 386
DM2 B 501