DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'DB01051'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1AJ6_A_NOVA1 1aj6 NOV

DB01051
(Novobiocin)
Escherichia coli GYRASE PF02518
(HATPase_c)
9 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
THR A 165
NOV A   1
1KIJ_A_NOVA400 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin)
Thermus
thermophilus
DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation
16 ILE B  10
ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
LYS A 102
PHE A 103
LYS A 109
VAL A 117
ARG A 135
THR A 166
NOV A 400
1KIJ_B_NOVB444 1kij NOV

DB01051
(Novobiocin)
Thermus
thermophilus
DNA GYRASE SUBUNIT B PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
no annotation
16 ILE A  10
ASN B  45
ASP B  48
GLU B  49
ASP B  72
ARG B  75
ILE B  77
PRO B  78
ASP B  80
ILE B  93
TYR B  94
PHE B 103
VAL B 117
ALA B 119
ARG B 135
THR B 166
NOV B 444
1S14_A_NOVA1300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin)
Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B
PF02518
(HATPase_c)
12 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV A1300
1S14_B_NOVB2300 1s14 NOV

DB01051
(Novobiocin)
Escherichia coli TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B
no annotation 13 ASN B2042
SER B2043
ASP B2045
GLU B2046
ASP B2069
ARG B2072
MET B2074
PRO B2075
ASP B2077
ALA B2086
ILE B2090
ARG B2132
THR B2163
NOV B2300
3LPS_A_NOVA901 3lps NOV

DB01051
(Novobiocin)
Xanthomonas
oryzae
TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B
PF00204
(DNA_gyraseB)
PF02518
(HATPase_c)
12 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV A 901
4URN_A_NOVA2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT
PF02518
(HATPase_c)
no annotation
14 ASP B  35
LYS B  36
ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
ASN B 186
NOV A2000
4URN_B_NOVB2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT
no annotation 11 ASN B  49
SER B  50
ASP B  52
GLU B  53
ASP B  76
ARG B  79
MET B  81
PRO B  82
ILE B  96
ARG B 138
THR B 168
NOV B2000
4URN_C_NOVC2000 4urn NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT
no annotation 11 ASN C  49
SER C  50
ASP C  52
GLU C  53
ASP C  76
ARG C  79
MET C  81
PRO C  82
ILE C  96
ARG C 138
THR C 168
NOV C2000
4URO_A_NOVA2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA GYRASE SUBUNIT B PF02518
(HATPase_c)
no annotation
15 ASN A  54
SER A  55
ASP A  57
GLU A  58
ASP A  81
ARG A  84
ILE A  86
PRO A  87
ASP A  89
GLN A  91
ILE A 102
SER A 128
ARG A 144
THR A 173
ARG D 200
NOV A2000
4URO_B_NOVB2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 13 ASN B  54
SER B  55
ASP B  57
GLU B  58
ASP B  81
ARG B  84
ILE B  86
PRO B  87
ASP B  89
GLN B  91
ILE B 102
SER B 128
ARG B 144
NOV B2000
4URO_C_NOVC2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 14 ASN C  54
ASP C  57
GLU C  58
ASP C  81
ARG C  84
ILE C  86
PRO C  87
ASP C  89
GLN C  91
ALA C  98
ILE C 102
SER C 128
ARG C 144
THR C 173
NOV C2000
4URO_D_NOVD2000 4uro NOV

DB01051
(Novobiocin)
Staphylococcus
aureus
DNA GYRASE SUBUNIT B no annotation 12 ASN D  54
SER D  55
GLU D  58
ASP D  81
ARG D  84
ILE D  86
PRO D  87
ASP D  89
ILE D 102
SER D 128
ARG D 144
THR D 173
NOV D2000
6B89_A_NOVA403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin)
Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB
no annotation 16 LEU A  72
HIS A  73
ALA A  76
TYR A  82
PRO A  84
GLU A  86
SER A  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG B  91
ARG B  92
LEU B  93
ALA B 101
VAL A 102
GLN B 136
ARG A 150
NOV A 403
6B89_B_NOVB403 6b89 NOV

DB01051
(Novobiocin)
Escherichia coli LIPOPOLYSACCHARIDE
EXPORT SYSTEM
ATP-BINDING PROTEIN
LPTB
no annotation 17 LEU B  72
HIS B  73
ALA B  76
TYR B  82
PRO B  84
GLU B  86
SER B  88
PHE A  90
PHE B  90
ARG A  91
ARG A  92
LEU A  93
ALA A 101
VAL B 102
GLN A 104
GLN A 136
ARG B 150
NOV B 403