DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'DB00523'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1EPB_A_9CRA165 1epb 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Rattus norvegicus EPIDIDYMAL RETINOIC
ACID-BINDING PROTEIN
PF00061
(Lipocalin)
19 PHE A   6
ILE A   8
PHE A  11
TRP A  15
MET A  39
VAL A  41
LEU A  48
LEU A  50
ALA A  67
PHE A  76
VAL A  78
LYS A  85
VAL A  87
VAL A  89
ALA A  98
ILE A 100
ILE A 102
LYS A 115
TYR A 117
9CR A 165
1EPB_B_9CRB165 1epb 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Rattus norvegicus EPIDIDYMAL RETINOIC
ACID-BINDING PROTEIN
no annotation 20 PHE B   6
ILE B   8
PHE B  11
TRP B  15
MET B  39
VAL B  41
LEU B  48
LEU B  50
ALA B  67
PHE B  76
VAL B  78
ARG B  80
LYS B  85
VAL B  87
VAL B  89
ALA B  98
ILE B 100
ILE B 102
LYS B 115
TYR B 117
9CR B 165
1FBY_A_9CRA500 1fby 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
13 ILE A 268
CYS A 269
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
9CR A 500
1FBY_B_9CRB1500 1fby 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 13 ILE B1268
CYS B1269
ALA B1271
ALA B1272
GLN B1275
PHE B1313
ARG B1316
LEU B1326
ALA B1327
VAL B1342
ILE B1345
CYS B1432
HIS B1435
9CR B1500
1FM6_A_9CRA501 1fm6 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 501
1FM6_U_9CRU502 1fm6 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 12 ALA U 271
ALA U 272
TRP U 305
PHE U 313
ARG U 316
LEU U 326
ALA U 327
VAL U 342
ILE U 345
CYS U 432
HIS U 435
LEU U 436
9CR U 502
1FM9_A_9CRA201 1fm9 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
15 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 201
1G5Y_B_9CRB501 1g5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 14 ILE B 268
ALA B 272
GLN B 275
LEU B 276
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
PHE B 438
PHE B 439
LEU B 441
ILE B 442
9CR B 501
1G5Y_C_9CRC502 1g5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 10 ALA C 272
LEU C 309
SER C 312
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
PHE C 438
PHE C 439
ILE C 442
9CR C 502
1K74_A_9CRA463 1k74 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
15 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 463
1TYR_A_9CRA131 1tyr 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens TRANSTHYRETIN PF00576
(Transthyretin)
6 LYS A  15
LEU A  17
ALA A 108
LEU A 110
SER A 117
THR A 119
9CR A 131
1TYR_B_9CRB130 1tyr 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens TRANSTHYRETIN no annotation 7 LYS B  15
LEU B  17
THR B 106
ALA B 108
LEU B 110
SER B 117
VAL B 121
9CR B 130
1XDK_A_9CRA500 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE A 273
ALA A 276
GLN A 280
TRP A 310
ASN A 311
PHE A 318
ARG A 321
LEU A 331
ALA A 332
VAL A 347
ILE A 350
CYS A 437
HIS A 440
LEU A 441
9CR A 500
1XDK_B_9CRB600 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR, BETA
PF00104
(Hormone_recep)
15 PHE B 221
LEU B 224
ALA B 225
CYS B 228
LEU B 259
LEU B 262
ILE B 263
ILE B 266
ARG B 269
PHE B 279
SER B 280
PHE B 295
LEU B 298
ARG B 387
LEU B 407
9CR B 600
1XDK_E_9CRE1500 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 14 ILE E 273
ALA E 276
ALA E 277
GLN E 280
TRP E 310
ASN E 311
PHE E 318
ARG E 321
LEU E 331
ALA E 332
VAL E 347
CYS E 437
HIS E 440
LEU E 441
9CR E1500
1XDK_F_9CRF1600 1xdk 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Mus musculus RETINOIC ACID
RECEPTOR, BETA
no annotation 15 PHE F 221
LEU F 224
ALA F 225
CYS F 228
LEU F 259
LEU F 262
ILE F 263
ILE F 266
ARG F 269
PHE F 279
SER F 280
PHE F 295
LEU F 298
ARG F 387
LEU F 407
9CR F1600
1XIU_A_9CRA201 1xiu 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Biomphalaria
glabrata
RXR-LIKE PROTEIN PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE A 242
CYS A 243
ALA A 245
ALA A 246
GLN A 249
LEU A 283
PHE A 287
ARG A 290
LEU A 300
ALA A 301
VAL A 316
CYS A 406
HIS A 409
LEU A 410
9CR A 201
1XIU_B_9CRB202 1xiu 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Biomphalaria
glabrata
RXR-LIKE PROTEIN no annotation 13 ILE B 242
ALA B 245
ALA B 246
GLN B 249
LEU B 283
PHE B 287
ARG B 290
ALA B 301
VAL B 316
ILE B 319
CYS B 406
HIS B 409
LEU B 410
9CR B 202
1XLS_A_9CRA801 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 801
1XLS_B_9CRB802 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 14 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
VAL B 342
CYS B 432
HIS B 435
LEU B 436
9CR B 802
1XLS_C_9CRC803 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 14 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
TRP C 305
LEU C 309
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
VAL C 342
CYS C 432
HIS C 435
LEU C 436
9CR C 803
1XLS_D_9CRD804 1xls 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 14 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
TRP D 305
LEU D 309
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
VAL D 342
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
9CR D 804
2NNH_A_9CRA501 2nnh 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 2C8 PF00067
(p450)
11 ARG A  97
GLY A  98
SER A 100
SER A 103
ILE A 113
SER A 114
ALA A 297
THR A 301
VAL A 366
PRO A 367
ILE A 476
9CR A 501
2NNH_A_9CRA502 2nnh 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 2C8 PF00067
(p450)
12 SER A 100
ILE A 102
SER A 103
ILE A 106
ASN A 204
LEU A 208
ASN A 209
ASN A 217
VAL A 237
ARG A 241
VAL A 296
ILE A 476
9CR A 502
2NNH_B_9CRB501 2nnh 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 2C8 no annotation 9 ARG B  97
GLY B  98
SER B 100
ILE B 113
THR B 301
VAL B 366
PRO B 367
ILE B 476
VAL B 477
9CR B 501
2NNH_B_9CRB502 2nnh 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens CYTOCHROME P450 2C8 no annotation 10 SER B 100
ILE B 102
ILE B 106
ASN B 204
LEU B 208
ASN B 209
ASN B 217
ARG B 241
VAL B 296
ILE B 476
9CR B 502
3DZU_A_9CRA7223 3dzu 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4)
13 ILE A 268
ALA A 271
GLN A 275
ASN A 306
ILE A 310
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A7223
3DZY_A_9CRA463 3dzy 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4)
13 ILE A 268
ALA A 271
GLN A 275
ASN A 306
SER A 312
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 463
3E00_A_9CRA7223 3e00 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4)
13 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
ASN A 306
PHE A 313
ARG A 316
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
9CR A7223
3LBD_A_9CRA424 3lbd 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR GAMMA
PF00104
(Hormone_recep)
14 PHE A 230
ALA A 234
LEU A 268
LEU A 271
MET A 272
ILE A 275
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
PHE A 304
GLY A 393
ALA A 397
LEU A 400
ILE A 412
9CR A 424
3OAP_A_9CRA500 3oap 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
ILE A 345
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 500
3UVV_B_9CRB501 3uvv 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
12 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
ALA B 327
VAL B 342
ILE B 345
CYS B 432
LEU B 436
9CR B 501
4NQA_A_9CRA501 4nqa 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
PF00105
(zf-C4)
11 ILE A 268
ALA A 272
GLN A 275
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
HIS A 435
LEU A 436
9CR A 501
4NQA_H_9CRH501 4nqa 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 12 ILE H 268
ALA H 271
ALA H 272
GLN H 275
PHE H 313
ARG H 316
LEU H 326
ALA H 327
ILE H 345
CYS H 432
HIS H 435
LEU H 436
9CR H 501
5JI0_A_9CRA501 5ji0 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
11 ILE A 268
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
LEU A 436
9CR A 501
5M24_A_9CRA501 5m24 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR GAMMA
PF00104
(Hormone_recep)
14 TRP A 227
PHE A 230
ALA A 234
LEU A 268
LEU A 271
MET A 272
ILE A 275
ARG A 278
PHE A 288
SER A 289
PHE A 304
GLY A 393
LEU A 400
ILE A 412
9CR A 501
5UAN_A_9CRA503 5uan 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 13 ILE A 268
ALA A 271
ALA A 272
GLN A 275
TRP A 305
LEU A 309
PHE A 313
ARG A 316
LEU A 326
ALA A 327
VAL A 342
CYS A 432
LEU A 436
9CR A 503
5Z12_B_9CRB501 5z12 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 15 ILE B 268
ALA B 271
ALA B 272
GLN B 275
TRP B 305
LEU B 309
PHE B 313
ARG B 316
LEU B 326
ALA B 327
VAL B 342
ILE B 345
CYS B 432
HIS B 435
LEU B 436
9CR B 501
5Z12_C_9CRC501 5z12 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
no annotation 13 ILE C 268
ALA C 271
ALA C 272
GLN C 275
TRP C 305
PHE C 313
ARG C 316
LEU C 326
ALA C 327
VAL C 342
ILE C 345
CYS C 432
LEU C 436
9CR C 501
6A5Y_D_9CRD501 6a5y 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
15 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
TRP D 305
ASN D 306
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
VAL D 342
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
9CR D 501
6A5Z_D_9CRD501 6a5z 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
13 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
ILE D 310
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
9CR D 501
6A5Z_L_9CRL501 6a5z 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
None 14 ILE L 268
ALA L 271
ALA L 272
GLN L 275
TRP L 305
ILE L 310
PHE L 313
ARG L 316
LEU L 326
ALA L 327
ILE L 345
CYS L 432
HIS L 435
LEU L 436
9CR L 501
6A60_D_9CRD501 6a60 9CR

DB00523
(Alitretinoin)
Homo sapiens RETINOIC ACID
RECEPTOR RXR-ALPHA
PF00104
(Hormone_recep)
14 ILE D 268
ALA D 271
ALA D 272
GLN D 275
LEU D 309
ILE D 310
PHE D 313
ARG D 316
LEU D 326
ALA D 327
ILE D 345
CYS D 432
HIS D 435
LEU D 436
9CR D 501