DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'DB00224'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1C6Y_B_MK1B524 1c6y MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEIN (PROTEASE) PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
VAL A  32
ILE A  47
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
THR A  82
ILE A  84
ASP B 225
GLY B 227
ALA B 228
ASP B 229
ASP B 230
VAL B 232
ILE B 247
GLY B 249
ILE B 250
THR B 280
PRO B 281
THR B 282
ILE B 284
MK1 B 524
1HSG_B_MK1B902 1hsg MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
23 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 B 902
1HSH_A_MK1A401 1hsh MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 2
HIV-II PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
21 ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP A  30
ILE A  32
ILE B  32
VAL A  47
VAL B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ILE B  82
ILE A  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 A 401
1HSH_C_MK1C402 1hsh MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 2
HIV-II PROTEASE no annotation 20 ARG D   8
ARG C   8
ASP D  25
ASP C  25
GLY C  27
ALA C  28
ALA D  28
ASP C  29
ASP C  30
ILE C  32
GLY C  49
GLY D  49
ILE C  50
ILE D  50
PRO C  81
PRO D  81
ILE C  82
ILE D  82
ILE C  84
ILE D  84
MK1 C 402
1K6C_B_MK1B902 1k6c MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
PRO B  81
PRO A  81
THR A  82
THR B  82
VAL B  84
MK1 B 902
1SDT_B_MK1B902 1sdt MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
22 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
MK1 B 902
1SDU_B_MK1B902 1sdu MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
VAL A  82
ILE A  84
ARG B 108
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
VAL B 182
ILE B 184
MK1 B 902
1SDV_B_MK1B902 1sdv MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE RETROPEPSIN PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ALA A  28
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
ILE A  84
ASP B 125
GLY B 127
ALA B 128
ASP B 129
ASP B 130
VAL B 132
ILE B 147
GLY B 149
ILE B 150
PRO B 181
ILE B 184
MK1 B 902
1SGU_B_MK1B2632 1sgu MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
20 ARG B   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
ILE B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY B  49
GLY A  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA A  82
ALA B  82
MK1 B2632
2AVO_B_MK1B902 2avo MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
21 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 B 902
2AVS_B_MK1B902 2avs MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
29 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
VAL B  50
VAL A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 B 902
2AVV_A_MK1A901 2avv MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN PF00077
(RVP)
no annotation
30 TRP D   6
ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
LEU B  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 A 901
2AVV_E_MK1E902 2avv MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
POL POLYPROTEIN no annotation 30 ARG E   8
ARG D   8
LEU E  23
LEU D  23
ASP E  25
ASP D  25
GLY D  27
GLY E  27
ALA D  28
ALA E  28
ASP E  29
ASP D  29
ASP D  30
ASP E  30
VAL E  32
VAL D  32
ILE E  47
ILE D  47
GLY D  48
GLY E  48
GLY E  49
GLY D  49
ILE E  50
ILE D  50
PRO D  81
PRO E  81
VAL D  82
VAL E  82
ILE E  84
ILE D  84
MK1 E 902
2B7Z_B_MK1B200 2b7z MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
26 ARG B   8
ARG A   8
ASP A  25
ASP B  25
GLY A  27
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP A  29
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
ILE B  32
ILE A  32
ILE A  47
ILE B  47
GLY A  49
GLY B  49
ILE B  50
ILE A  50
PRO A  81
PRO B  81
ALA B  82
ALA A  82
VAL A  84
VAL B  84
MK1 B 200
2BPX_B_MK1B902 2bpx MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
HIV-1 PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
20 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ALA A  28
ASP B  29
ASP B  30
VAL B  32
VAL A  32
ILE B  47
GLY B  49
GLY A  49
PRO B  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 B 902
2R5P_B_MK1B902 2r5p MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
24 ARG B   8
ARG A   8
LEU A  23
ASP A  25
ASP B  25
GLY B  27
ALA B  28
ASP B  29
ASP B  30
ASP A  30
VAL A  32
VAL B  32
ILE B  47
ILE A  47
GLY A  48
GLY A  49
GLY B  49
ILE A  50
PRO B  81
PRO A  81
VAL A  82
VAL B  82
ILE A  84
ILE B  84
MK1 B 902
2R5P_D_MK1D902 2r5p MK1

DB00224
(Indinavir)
Human
immunodeficiency
virus 1
PROTEASE no annotation 25 ARG D   8
ARG C   8
LEU C  23
ASP D  25
ASP C  25
GLY D  27
ALA D  28
ASP D  29
ASP C  30
ASP D  30
VAL C  32
VAL D  32
ILE D  47
ILE C  47
GLY C  48
GLY D  49
GLY C  49
ILE D  50
ILE C  50
PRO D  81
PRO C  81
VAL D  82
VAL C  82
ILE D  84
ILE C  84
MK1 D 902
3WSJ_A_MK1A201 3wsj MK1

DB00224
(Indinavir)
Primate
T-lymphotropic
virus 1
PROTEASE PF00077
(RVP)
no annotation
16 ARG A  10
ARG B  10
LEU B  30
LEU A  30
ASP A  32
ASP B  32
ALA B  35
ALA A  35
ASP A  36
VAL A  39
VAL B  56
LEU A  91
TRP A  98
TRP B  98
ILE B 100
ILE A 100
MK1 A 201