DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'COLCHICINE'

List of Binding Interfaces

(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
3E22_B_LOCB700 3e22 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1C
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
14 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
LOC B 700
3E22_D_LOCD700 3e22 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1C
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
no annotation 14 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
LOC D 700
3UT5_B_LOCB502 3ut5 LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
14 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
3UT5_D_LOCD502 3ut5 LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 14 ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
GLN D 247
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
ALA D 316
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 502
4LZR_A_LOCA201 4lzr LOC

DB01394
(Colchicine)
Homo sapiens BROMODOMAIN-CONTAINI
NG PROTEIN 4
PF00439
(Bromodomain)
8 TRP A  81
VAL A  87
LEU A  92
LEU A  94
TYR A 139
ASN A 140
ASP A 144
ILE A 146
LOC A 201
4O2B_B_LOCB503 4o2b LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
16 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 503
4O2B_D_LOCD503 4o2b LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
no annotation 17 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
ALA D 250
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
ILE D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 503
4X1I_B_LOCB502 4x1i LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ALA B 354
LOC B 502
4X1I_D_LOCD502 4x1i LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 14 ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 502
4X1K_B_LOCB502 4x1k LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
12 SER A 178
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
THR B 314
LYS B 352
ALA B 354
LOC B 502
4X1K_D_LOCD502 4x1k LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 17 ASN C 101
SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 502
4X1Y_B_LOCB502 4x1y LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
4X1Y_D_LOCD502 4x1y LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 16 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 241
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ALA D 354
ILE D 378
LOC D 502
4X20_B_LOCB502 4x20 LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
16 SER A 178
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
VAL B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
LOC B 502
4X20_D_LOCD502 4x20 LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 14 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
LEU D 242
LEU D 248
LYS D 254
LEU D 255
ASN D 258
MET D 259
THR D 314
ALA D 316
VAL D 318
LYS D 352
ILE D 378
LOC D 502
5EYP_B_LOCB502 5eyp LOC

DB01394
(Colchicine)
Ovis aries TUBULIN ALPHA CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
17 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
LOC B 502
5ITZ_B_LOCB502 5itz LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
5MIO_B_LOCB502 5mio LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus;
Ovis aries
TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
15 ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ILE B 378
LOC B 502
5NKN_A_LOCA201 5nkn LOC

DB01394
(Colchicine)
Homo sapiens NEUTROPHIL
GELATINASE-ASSOCIATE
D LIPOCALIN
no annotation 15 GLY A  40
PHE A  41
VAL A  66
PHE A  68
LYS A  70
PHE A  71
MET A  73
MET A  79
LEU A  94
TRP A 106
ARG A 130
ASP A 132
PHE A 134
THR A 136
TYR A 138
LOC A 201
5NM5_B_LOCB502 5nm5 LOC

DB01394
(Colchicine)
Bos taurus TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA-2B
CHAIN
PF00091
(Tubulin)
PF03953
(Tubulin_C)
18 ASN A 101
SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 241
LEU B 242
LEU B 248
ALA B 250
LYS B 254
LEU B 255
ASN B 258
MET B 259
THR B 314
ALA B 316
ILE B 318
LYS B 352
ALA B 354
ILE B 378
LOC B 502
5XIW_B_LOCB504 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine)
Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 17 SER A 178
ALA A 180
VAL A 181
CYS B 239
LEU B 240
LEU B 246
ALA B 248
LYS B 252
LEU B 253
ASN B 256
MET B 257
THR B 312
ALA B 314
ILE B 316
LYS B 350
ALA B 352
ILE B 368
LOC B 504
5XIW_D_LOCD503 5xiw LOC

DB01394
(Colchicine)
Sus scrofa TUBULIN ALPHA-1B
CHAIN;
TUBULIN BETA CHAIN
no annotation 17 SER C 178
ALA C 180
VAL C 181
CYS D 239
LEU D 240
LEU D 246
ALA D 248
LYS D 252
LEU D 253
ASN D 256
MET D 257
THR D 312
ALA D 314
ILE D 316
LYS D 350
ALA D 352
ILE D 368
LOC D 503