SIMILAR PATTERN OF AMINO ACIDS MAPPED TO 'NOV'


List of Similar Pattern of Amino Acids


Hit pattern: 3D amino acid arrangements similar to known drug binding site

Query pattern: Residues from known binding site for annotated drug that match the hit pattern


(Click on the DrReposER ID to view details on interfaces and similar patterns of amino acids)
(Click on the view link on the last column to view superposed patterns of amino acids)
Filter list by:
DrReposER ID / Desc. Hit
PDBID
Hit
Macromolecule
Res.
Matches
Interface HETATM RMSD Dali
Z-score
Seq.
Identity (%)
View Dock
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1AJ6_A_NOVA1_1
(GYRASE)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 9 ASN A  45
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ALA A  89
ILE A  93
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.1A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 ( 4.1A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.46A 1aj6A-1kijA:
28.2
1aj6A-1kijA:
35.74
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1AJ6_A_NOVA1_1
(GYRASE)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
8 / 9 ASN A1042
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ALA A1086
ILE A1090
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 ( 4.3A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.53A 1aj6A-1s14A:
23.3
1aj6A-1s14A:
39.19
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1AJ6_A_NOVA1_1
(GYRASE)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
7 / 9 ASN A  86
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ILE A 134
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.51A 1aj6A-3lpsA:
27.3
1aj6A-3lpsA:
32.30
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1AJ6_A_NOVA1_1
(GYRASE)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
7 / 9 ASN A  49
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
THR A 168
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.66A 1aj6A-4urnA:
29.1
1aj6A-4urnA:
52.42
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_A_NOVA400_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.46A 1kijA-1aj6A:
28.2
1kijA-1aj6A:
35.74
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
1KIJ_A_NOVA400_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
9 / 12 ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
None
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.31A 1kijA-1s14A:
24.0
1kijA-1s14A:
27.82
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_A_NOVA400_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
9 / 12 ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.45A 1kijA-3lpsA:
39.5
1kijA-3lpsA:
36.84
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_A_NOVA400_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
8 / 12 ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
NOV  A2000 (-4.6A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.89A 1kijA-4urnA:
27.9
1kijA-4urnA:
32.07
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_B_NOVB444_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
8 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.42A 1kijB-1aj6A:
28.2
1kijB-1aj6A:
35.74
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
1KIJ_B_NOVB444_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
9 / 12 ASN A1042
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.38A 1kijB-1s14A:
24.5
1kijB-1s14A:
27.82
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_B_NOVB444_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
9 / 12 ASN A  86
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.53A 1kijB-3lpsA:
39.2
1kijB-3lpsA:
36.84
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_B_NOVB444_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
9 / 12 ASN A  49
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ALA A 122
ARG A 138
THR A 168
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 ( 4.6A)
NOV  A2000 (-2.9A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.78A 1kijB-4urnA:
28.2
1kijB-4urnA:
32.07
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_A_NOVA1300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.51A 1s14A-1aj6A:
23.3
1s14A-1aj6A:
39.19
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
1S14_A_NOVA1300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
10 / 12 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.38A 1s14A-1kijA:
24.0
1s14A-1kijA:
27.82
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_A_NOVA1300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
12 / 12 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-3.7A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.46A 1s14A-3lpsA:
27.5
1s14A-3lpsA:
41.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_A_NOVA1300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
11 / 12 ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-4.6A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.79A 1s14A-4urnA:
24.9
1s14A-4urnA:
38.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_B_NOVB2300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 3.9A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
0.53A 1s14B-1aj6A:
25.4
1s14B-1aj6A:
39.19
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
1S14_B_NOVB2300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
10 / 12 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ASP A  80
ALA A  89
ILE A  93
ARG A 135
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 ( 4.1A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
0.43A 1s14B-1kijA:
26.2
1s14B-1kijA:
27.82
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_B_NOVB2300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
11 / 12 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-3.7A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
0.55A 1s14B-3lpsA:
29.8
1s14B-3lpsA:
41.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_B_NOVB2300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
10 / 12 ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-4.6A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
0.92A 1s14B-4urnA:
26.9
1s14B-4urnA:
38.33
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
2Y7H_B_SAMB530_0
(TYPE I RESTRICTION
ENZYME ECOKI M
PROTEIN)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
5 / 12 ILE A 134
ALA A  47
GLY A  77
ASN A 198
LEU A 194
None
NOV  A   1 ( 4.2A)
None
None
None
1.03A 2y7hB-1aj6A:
undetectable
2y7hB-1aj6A:
17.42
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3LPS_A_NOVA901_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.51A 3lpsA-1aj6A:
27.3
3lpsA-1aj6A:
32.30
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3LPS_A_NOVA901_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
10 / 12 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.50A 3lpsA-1kijA:
39.5
3lpsA-1kijA:
36.84
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3LPS_A_NOVA901_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
12 / 12 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
None
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.46A 3lpsA-1s14A:
27.5
3lpsA-1s14A:
41.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3LPS_A_NOVA901_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
11 / 12 ASN A  49
SER A  50
ASP A  52
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
MET A  81
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-4.6A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.69A 3lpsA-4urnA:
27.9
3lpsA-4urnA:
30.05
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_A_NOVA2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 11 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.66A 4urnA-1aj6A:
29.1
4urnA-1aj6A:
52.42
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_A_NOVA2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 11 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.85A 4urnA-1kijA:
27.9
4urnA-1kijA:
32.07
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_A_NOVA2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
11 / 11 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
None
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.79A 4urnA-1s14A:
24.9
4urnA-1s14A:
38.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_A_NOVA2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
11 / 11 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-3.7A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.69A 4urnA-3lpsA:
27.9
4urnA-3lpsA:
30.05
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_B_NOVB2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 11 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.56A 4urnB-1aj6A:
26.2
4urnB-1aj6A:
52.42
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_B_NOVB2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 11 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.72A 4urnB-1kijA:
25.9
4urnB-1kijA:
32.07
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_B_NOVB2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
11 / 11 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
None
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.63A 4urnB-1s14A:
26.4
4urnB-1s14A:
38.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_B_NOVB2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
11 / 11 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-3.7A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.57A 4urnB-3lpsA:
26.2
4urnB-3lpsA:
30.05
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_C_NOVC2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 11 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.60A 4urnC-1aj6A:
28.2
4urnC-1aj6A:
52.42
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_C_NOVC2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 11 ASN A  45
ASP A  48
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
PRO A  78
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.69A 4urnC-1kijA:
28.2
4urnC-1kijA:
32.07
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_C_NOVC2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
11 / 11 ASN A1042
SER A1043
ASP A1045
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
MET A1074
PRO A1075
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
None
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.61A 4urnC-1s14A:
25.2
4urnC-1s14A:
38.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_C_NOVC2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
11 / 11 ASN A  86
SER A  87
ASP A  89
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
MET A 118
PRO A 119
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 ( 4.8A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-3.7A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.56A 4urnC-3lpsA:
27.9
4urnC-3lpsA:
30.05
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
0.41A 4uroA-1aj6A:
28.5
4uroA-1aj6A:
55.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 12 ASN A  45
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
ARG A 135
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.1A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
0.44A 4uroA-1kijA:
28.0
4uroA-1kijA:
32.11
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
9 / 12 ASN A1042
SER A1043
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
0.49A 4uroA-1s14A:
26.0
4uroA-1s14A:
37.34
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
9 / 12 ASN A  86
SER A  87
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
0.52A 4uroA-3lpsA:
27.5
4uroA-3lpsA:
30.53
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
8 / 12 ASN A  49
SER A  50
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
0.66A 4uroA-4urnA:
30.0
4uroA-4urnA:
58.62
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
7 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
0.50A 4uroB-1aj6A:
28.8
4uroB-1aj6A:
55.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
9 / 12 ASN A  45
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
ARG A 135
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.1A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
0.51A 4uroB-1kijA:
28.1
4uroB-1kijA:
32.11
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
9 / 12 ASN A1042
SER A1043
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
0.52A 4uroB-1s14A:
26.1
4uroB-1s14A:
37.34
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
9 / 12 ASN A  86
SER A  87
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
0.54A 4uroB-3lpsA:
27.6
4uroB-3lpsA:
30.53
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
8 / 12 ASN A  49
SER A  50
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
0.63A 4uroB-4urnA:
30.2
4uroB-4urnA:
58.62
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
6 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ARG A  76
PRO A  79
ALA A  91
ILE A  94
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.2A)
None
NOV  A   1 ( 4.4A)
1.36A 4uroC-1aj6A:
28.6
4uroC-1aj6A:
55.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
8 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 3.9A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
0.46A 4uroC-1aj6A:
28.6
4uroC-1aj6A:
55.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
10 / 12 ASN A  45
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ALA A  89
ILE A  93
ARG A 135
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.1A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 ( 4.1A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
0.51A 4uroC-1kijA:
28.1
4uroC-1kijA:
32.11
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
9 / 12 ASN A1042
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ALA A1086
ILE A1090
ARG A1132
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.3A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
0.54A 4uroC-1s14A:
26.0
4uroC-1s14A:
37.34
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
8 / 12 ASN A  86
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
0.53A 4uroC-3lpsA:
28.0
4uroC-3lpsA:
30.53
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
7 / 12 ASN A  49
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
0.65A 4uroC-4urnA:
30.5
4uroC-4urnA:
58.62
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1aj6 GYRASE
(Escherichia
coli)
8 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
THR A 165
NOV  A   1 (-4.0A)
NOV  A   1 (-3.8A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-3.5A)
NOV  A   1 (-4.1A)
NOV  A   1 (-4.2A)
NOV  A   1 ( 4.4A)
NOV  A   1 ( 4.1A)
0.43A 4uroD-1aj6A:
28.9
4uroD-1aj6A:
55.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
10 / 12 ASN A  45
GLU A  49
ASP A  72
ARG A  75
ILE A  77
PRO A  78
ASP A  80
ILE A  93
ARG A 135
THR A 166
NOV  A 400 (-3.8A)
NOV  A 400 (-3.6A)
NOV  A 400 (-3.1A)
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.1A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-2.8A)
NOV  A 400 (-4.5A)
NOV  A 400 (-2.7A)
NOV  A 400 (-3.3A)
0.40A 4uroD-1kijA:
27.4
4uroD-1kijA:
32.11
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
1s14 TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Escherichia
coli)
10 / 12 ASN A1042
SER A1043
GLU A1046
ASP A1069
ARG A1072
PRO A1075
ASP A1077
ILE A1090
ARG A1132
THR A1163
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.6A)
NOV  A1300 (-3.7A)
NOV  A1300 (-3.4A)
NOV  A1300 (-3.1A)
NOV  A1300 (-4.5A)
NOV  A1300 (-2.7A)
NOV  A1300 ( 4.6A)
NOV  A1300 (-2.9A)
NOV  A1300 ( 4.0A)
0.50A 4uroD-1s14A:
25.1
4uroD-1s14A:
37.34
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
5 / 12 ASN A  86
ASP A 113
ARG A 176
ILE A 134
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
1.35A 4uroD-3lpsA:
27.1
4uroD-3lpsA:
30.53
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
3lps TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B

(Xanthomonas
oryzae)
10 / 12 ASN A  86
SER A  87
GLU A  90
ASP A 113
ARG A 116
PRO A 119
ASP A 121
ILE A 134
ARG A 176
THR A 207
NOV  A 901 (-4.0A)
NOV  A 901 (-3.3A)
NOV  A 901 (-3.8A)
NOV  A 901 (-3.5A)
NOV  A 901 (-3.4A)
NOV  A 901 (-4.5A)
NOV  A 901 (-2.6A)
NOV  A 901 ( 4.9A)
NOV  A 901 (-2.5A)
NOV  A 901 ( 4.2A)
0.49A 4uroD-3lpsA:
27.1
4uroD-3lpsA:
30.53
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
9 / 12 ASN A  49
SER A  50
GLU A  53
ASP A  76
ARG A  79
PRO A  82
ILE A  96
ARG A 138
THR A 168
NOV  A2000 (-3.8A)
NOV  A2000 ( 3.7A)
NOV  A2000 (-3.4A)
NOV  A2000 (-3.5A)
NOV  A2000 (-3.2A)
NOV  A2000 (-4.1A)
NOV  A2000 (-4.2A)
NOV  A2000 (-2.9A)
NOV  A2000 (-3.9A)
0.62A 4uroD-4urnA:
29.9
4uroD-4urnA:
58.62
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
5NY7_A_NCAA303_0
(AMIDASE)
1kij DNA GYRASE SUBUNIT B
(Thermus
thermophilus)
4 / 6 ARG A  75
PRO A  78
THR A 166
GLU A  49
NOV  A 400 (-3.4A)
NOV  A 400 (-4.4A)
NOV  A 400 (-3.3A)
NOV  A 400 (-3.6A)
1.05A 5ny7A-1kijA:
undetectable
5ny7A-1kijA:
22.25
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
6F88_B_STRB502_1
(CYTOCHROME P450
CYP260A1)
4urn DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT

(Staphylococcus
aureus)
4 / 6 LEU A 204
LEU A 194
SER A  50
ASN A 209
None
None
NOV  A2000 ( 3.7A)
None
0.95A 6f88B-4urnA:
undetectable
6f88B-4urnA:
13.78