SIMILAR PATTERN OF AMINO ACIDS MAPPED TO '4S4'


List of Similar Pattern of Amino Acids

Hit pattern: 3D amino acid arrangements similar to known drug binding site
Query pattern: Residues from known binding site for annotated drug that match the hit pattern

(Click on the DrReposER ID to view details on interfaces and similar patterns of amino acids)
(Click on the view link on the last column to view superposed patterns of amino acids)
Filter list by:
DrReposER ID / Desc. Hit
PDBID		 Hit
Macromolecule		 Res.
Matches		 Interface HETATM RMSD Dali
Z-score		 Seq.
Identity (%)		 View Dock
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1AJ6_A_NOVA1_1
(GYRASE)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 9 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.40A 1aj6A-4zviA:
31.5		 1aj6A-4zviA:
99.51
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_A_NOVA400_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.59A 1kijA-4zviA:
42.3		 1kijA-4zviA:
45.66
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1KIJ_B_NOVB444_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.48A 1kijB-4zviA:
42.4		 1kijB-4zviA:
45.66
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_A_NOVA1300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.61A 1s14A-4zviA:
25.4		 1s14A-4zviA:
30.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
1S14_B_NOVB2300_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
ARG A 136
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
None
 0.69A 1s14B-4zviA:
27.5		 1s14B-4zviA:
30.33
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3LPS_A_NOVA901_1
(TOPOISOMERASE IV
SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.64A 3lpsA-4zviA:
39.6		 3lpsA-4zviA:
38.90
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_A_NOVA2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 11 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.58A 4urnA-4zviA:
30.1		 4urnA-4zviA:
39.58
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_B_NOVB2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 11 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.43A 4urnB-4zviA:
27.7		 4urnB-4zviA:
39.58
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URN_C_NOVC2000_1
(DNA TOPOISOMERASE
IV, B SUBUNIT)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 11 ASN A  46
ASP A  49
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
None
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.45A 4urnC-4zviA:
29.7		 4urnC-4zviA:
39.58
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_A_NOVA2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		8 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
 0.44A 4uroA-4zviA:
30.6		 4uroA-4zviA:
57.69
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_B_NOVB2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		8 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
 0.47A 4uroB-4zviA:
30.9		 4uroB-4zviA:
57.69
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_C_NOVC2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ALA A  90
ILE A  94
ARG A 136
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
None
 0.48A 4uroC-4zviA:
30.8		 4uroC-4zviA:
57.69
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
4URO_D_NOVD2000_1
(DNA GYRASE SUBUNIT B)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		9 / 12 ASN A  46
GLU A  50
ASP A  73
ARG A  76
ILE A  78
PRO A  79
ILE A  94
ARG A 136
THR A 165
 4S4  A 401 (-4.3A)
4S4  A 401 (-3.1A)
4S4  A 401 (-3.4A)
4S4  A 401 (-2.8A)
4S4  A 401 (-4.4A)
4S4  A 401 (-4.5A)
None
None
4S4  A 401 ( 3.8A)
 0.44A 4uroD-4zviA:
30.0		 4uroD-4zviA:
57.69
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
5E4D_B_BEZB201_0
(HYDROXYNITRILE LYASE)		 4zvi DNA GYRASE SUBUNIT B
(Escherichia
coli) 		5 / 11 VAL A  69
VAL A  61
VAL A  71
PHE A  41
LEU A 187
 None
None
4S4  A 401 ( 4.9A)
None
None
 1.08A 5e4dB-4zviA:
undetectable		 5e4dB-4zviA:
19.01