SIMILAR PATTERN OF AMINO ACIDS MAPPED TO '2R8'


List of Similar Pattern of Amino Acids

Hit pattern: 3D amino acid arrangements similar to known drug binding site
Query pattern: Residues from known binding site for annotated drug that match the hit pattern

(Click on the DrReposER ID to view details on interfaces and similar patterns of amino acids)
(Click on the view link on the last column to view superposed patterns of amino acids)
Filter list by:
DrReposER ID / Desc. Hit
PDBID		 Hit
Macromolecule		 Res.
Matches		 Interface HETATM RMSD Dali
Z-score		 Seq.
Identity (%)		 View Dock
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
2OC8_A_HU5A999_1
(HEPATITIS C VIRUS)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		8 / 12 ARG A 123
ILE A 132
LEU A 135
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
VAL A 158
 None
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 0.73A 2oc8A-4nwkA:
29.9		 2oc8A-4nwkA:
81.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
2OC8_A_HU5A999_1
(HEPATITIS C VIRUS)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		8 / 12 GLN A  41
HIS A  57
ILE A 132
LEU A 135
GLY A 137
ALA A 156
ALA A 157
VAL A 158
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 0.71A 2oc8A-4nwkA:
29.9		 2oc8A-4nwkA:
81.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
2OC8_A_HU5A999_1
(HEPATITIS C VIRUS)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		9 / 12 HIS A  57
ILE A 132
LEU A 135
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
VAL A 158
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 0.73A 2oc8A-4nwkA:
29.9		 2oc8A-4nwkA:
81.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
2OC8_A_HU5A999_1
(HEPATITIS C VIRUS)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 LEU A 135
GLY A 137
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 157
VAL A 158
 2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 1.01A 2oc8A-4nwkA:
29.9		 2oc8A-4nwkA:
81.04
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_A_30BA500_1
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.34A 3keeA-4nwkA:
30.9		 3keeA-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_B_30BB500_1
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.39A 3keeB-4nwkA:
30.5		 3keeB-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_B_30BB500_2
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		3 / 3 PHE A  43
TYR A  56
LEU A 135
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.38A 3keeB-4nwkA:
30.5		 3keeB-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_C_30BC500_1
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.23A 3keeC-4nwkA:
30.5		 3keeC-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_C_30BC500_2
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 4 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
LEU A 135
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.62A 3keeC-4nwkA:
30.5		 3keeC-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3KEE_D_30BD500_1
(GENOME POLYPROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		12 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.45A 3keeD-4nwkA:
31.0		 3keeD-4nwkA:
75.36
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		8 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.20A 3sudA-4nwkA:
34.8		 3sudA-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_A_SUEA1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 4 PHE A  43
TYR A  56
ILE A 132
LEU A 135
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.52A 3sudA-4nwkA:
34.8		 3sudA-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_B_SUEB1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		10 / 12 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
ILE A 132
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 156
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
 0.50A 3sudB-4nwkA:
35.6		 3sudB-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_C_SUEC1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		5 / 12 ARG A 123
ILE A 132
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 157
 None
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.94A 3sudC-4nwkA:
35.5		 3sudC-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_C_SUEC1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		10 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
ILE A 132
GLY A 137
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.61A 3sudC-4nwkA:
35.5		 3sudC-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		10 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ASP A  81
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.52A 3sudD-4nwkA:
34.4		 3sudD-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUD_D_SUED1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 5 PHE A  43
TYR A  56
LEU A 135
ARG A 155
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.4A)
2R8  A 301 (-3.6A)
 0.55A 3sudD-4nwkA:
34.4		 3sudD-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
ILE A 132
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.40A 3sueA-4nwkA:
35.7		 3sueA-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_B_SUEB1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		9 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.26A 3sueB-4nwkA:
34.6		 3sueB-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_B_SUEB1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 HIS A  57
ARG A 123
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 157
 2R8  A 301 (-3.3A)
None
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.78A 3sueB-4nwkA:
34.6		 3sueB-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_B_SUEB1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		3 / 3 PHE A  43
TYR A  56
LEU A 135
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.31A 3sueB-4nwkA:
34.6		 3sueB-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_C_SUEC1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ASP A  81
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.73A 3sueC-4nwkA:
35.1		 3sueC-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_C_SUEC1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 5 PHE A  43
TYR A  56
ILE A 132
LEU A 135
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.54A 3sueC-4nwkA:
35.1		 3sueC-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		5 / 12 GLN A  41
ARG A 123
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
 2R8  A 301 ( 3.5A)
None
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
 0.80A 3sueD-4nwkA:
33.8		 3sueD-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		5 / 12 GLN A  41
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 1.19A 3sueD-4nwkA:
33.8		 3sueD-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUE_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		9 / 12 GLN A  41
PHE A  43
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
 0.30A 3sueD-4nwkA:
33.8		 3sueD-4nwkA:
98.98
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		5 / 12 ARG A 123
LEU A 135
LYS A 136
PHE A 154
ALA A 157
 None
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.87A 3sufA-4nwkA:
34.5		 3sufA-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
LEU A 135
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.34A 3sufA-4nwkA:
34.5		 3sufA-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_B_SUEB1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		12 / 12 GLN A  41
PHE A  43
VAL A  55
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
ILE A 132
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.43A 3sufB-4nwkA:
35.1		 3sufB-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_B_SUEB1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		3 / 3 TYR A  56
LEU A 135
ARG A 155
 None
2R8  A 301 (-4.4A)
2R8  A 301 (-3.6A)
 0.53A 3sufB-4nwkA:
35.1		 3sufB-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_C_SUEC1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 11 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
HIS A  57
GLY A  58
ASP A  81
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.51A 3sufC-4nwkA:
35.2		 3sufC-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 HIS A  57
GLY A  58
ILE A 132
GLY A 137
PHE A 154
CYH A 159
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
None
 0.77A 3sufD-4nwkA:
32.3		 3sufD-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_D_SUED1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 VAL A  55
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ASP A  81
ILE A 132
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
 None
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.69A 3sufD-4nwkA:
32.3		 3sufD-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUF_D_SUED1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 5 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
ARG A 155
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
 0.38A 3sufD-4nwkA:
32.3		 3sufD-4nwkA:
99.49
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUG_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ASP A  81
GLY A 137
ARG A 155
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.6A)
 0.89A 3sugA-4nwkA:
34.8		 3sugA-4nwkA:
98.48
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUG_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 12 HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ASP A  81
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 157
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.40A 3sugA-4nwkA:
34.8		 3sugA-4nwkA:
98.48
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUG_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
GLY A 137
ARG A 155
ASP A 168
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 1.11A 3sugA-4nwkA:
34.8		 3sugA-4nwkA:
98.48
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUG_A_SUEA1201_1
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 12 HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 157
ASP A 168
 2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.78A 3sugA-4nwkA:
34.8		 3sugA-4nwkA:
98.48
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
3SUG_A_SUEA1201_2
(NS3 PROTEASE, NS4A
PROTEIN)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		4 / 5 GLN A  41
PHE A  43
TYR A  56
LEU A 135
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.4A)
 0.58A 3sugA-4nwkA:
34.8		 3sugA-4nwkA:
98.48
Potential target for repurposing, i.e. matched protein structure has less than 30% sequence identity to known drug target, and may potentially interact with the same drug molecule based on local structural similarity of binding site.
5I6X_A_8PRA705_1
(SODIUM-DEPENDENT
SEROTONIN
TRANSPORTER)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		5 / 10 ASP A 112
TYR A 134
PHE A 154
GLY A 137
VAL A 167
 None
None
2R8  A 301 (-3.7A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
None
 1.14A 5i6xA-4nwkA:
undetectable		 5i6xA-4nwkA:
16.09
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_A_SUEA1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 ARG A 123
ILE A 132
LEU A 135
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
 None
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
 0.87A 6c2mA-4nwkA:
34.6		 6c2mA-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_A_SUEA1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
PHE A  43
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ILE A 132
LEU A 135
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
 0.44A 6c2mA-4nwkA:
34.6		 6c2mA-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_A_SUEA1202_1
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 9 VAL A  55
ASP A  81
LYS A 136
ARG A 155
ALA A 157
VAL A 158
ASP A 168
 None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.32A 6c2mA-4nwkA:
34.6		 6c2mA-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_B_SUEB1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 ARG A 123
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 157
 None
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 1.50A 6c2mB-4nwkA:
35.5		 6c2mB-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_B_SUEB1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
PHE A  43
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ILE A 132
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-4.6A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
 0.56A 6c2mB-4nwkA:
35.5		 6c2mB-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_B_SUEB1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 12 PHE A  43
ARG A 123
ILE A 132
LYS A 136
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
 0.79A 6c2mB-4nwkA:
35.5		 6c2mB-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_B_SUEB1202_1
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 9 VAL A  55
ASP A  81
LEU A 135
ARG A 155
ALA A 157
VAL A 158
ASP A 168
 None
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-4.4A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.28A 6c2mB-4nwkA:
35.5		 6c2mB-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_C_SUEC1203_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 12 GLN A  41
ARG A 123
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 157
VAL A 158
 2R8  A 301 ( 3.5A)
None
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 0.90A 6c2mC-4nwkA:
35.5		 6c2mC-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_C_SUEC1203_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		10 / 12 GLN A  41
HIS A  57
VAL A  78
ASP A  81
GLY A 137
SER A 139
PHE A 154
ALA A 156
ALA A 157
VAL A 158
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
None
2R8  A 301 (-3.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-2.6A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
2R8  A 301 ( 4.4A)
 0.46A 6c2mC-4nwkA:
35.5		 6c2mC-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_C_SUEC1203_1
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		7 / 9 PHE A  43
VAL A  55
GLY A  58
ILE A 132
LEU A 135
ARG A 155
ASP A 168
 2R8  A 301 (-4.6A)
None
2R8  A 301 (-3.5A)
2R8  A 301 (-4.3A)
2R8  A 301 (-4.4A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 ( 4.5A)
 0.41A 6c2mC-4nwkA:
35.5		 6c2mC-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_D_SUED1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		6 / 12 ARG A 123
ILE A 132
LYS A 136
GLY A 137
PHE A 154
ALA A 157
 None
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.86A 6c2mD-4nwkA:
34.5		 6c2mD-4nwkA:
95.00
Available target for annotated drug, i.e. matched protein structure has more than 30% sequence identity to known drug target.
6C2M_D_SUED1202_0
(NS3 PROTEASE)		 4nwk HCV NS3 1A PROTEASE
(Hepacivirus
C) 		11 / 12 GLN A  41
HIS A  57
GLY A  58
VAL A  78
ILE A 132
LYS A 136
GLY A 137
PHE A 154
ARG A 155
ALA A 156
ALA A 157
 2R8  A 301 ( 3.5A)
2R8  A 301 (-3.3A)
2R8  A 301 (-3.5A)
None
2R8  A 301 (-4.3A)
GOL  A 310 ( 2.6A)
GOL  A 305 ( 3.2A)
2R8  A 301 (-3.7A)
2R8  A 301 (-3.6A)
2R8  A 301 (-3.1A)
2R8  A 301 (-3.8A)
 0.52A 6c2mD-4nwkA:
34.5		 6c2mD-4nwkA:
95.00