KNOWN TARGETS FROM HUMAN (PROTEIN-DRUG COMPLEXES IN THE PDB)

1) Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters
2) Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM View
1T69_A_SHHA379 1t69 SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
8
PF00850
(Hist_deacetyl)
12 TYR A 100
ASP A 101
HIS A 142
HIS A 143
GLY A 151
PHE A 152
ASP A 178
HIS A 180
PHE A 208
ASP A 267
MET A 274
TYR A 306
SHH A 379
3C0Z_A_SHHA301 3c0z SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
7A
PF00850
(Hist_deacetyl)
5 HIS A 669
HIS A 670
ASP A 707
HIS A 709
ASP A 801
SHH A 301
3C0Z_B_SHHB301 3c0z SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
7A
no annotation 8 HIS B 669
HIS B 670
PHE B 679
ASP B 707
HIS B 709
PHE B 738
ASP B 801
GLY B 841
SHH B 301
3C0Z_C_SHHC301 3c0z SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
7A
no annotation 6 ASP C 626
HIS C 669
HIS C 670
ASP C 707
HIS C 709
ASP C 801
SHH C 301
4LXZ_A_SHHA407 4lxz SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
2
PF00850
(Hist_deacetyl)
12 HIS A  33
PRO A  34
ASP A 104
HIS A 145
HIS A 146
GLY A 154
PHE A 155
ASP A 181
HIS A 183
ASP A 269
GLY A 306
TYR A 308
SHH A 407
4LXZ_B_SHHB408 4lxz SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
2
no annotation 11 HIS B  33
PRO B  34
ASP B 104
HIS B 145
HIS B 146
PHE B 155
ASP B 181
HIS B 183
ASP B 269
GLY B 306
TYR B 308
SHH B 408
4LXZ_C_SHHC406 4lxz SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
2
no annotation 12 PRO C  34
ASP C 104
HIS C 145
HIS C 146
GLY C 154
PHE C 155
ASP C 181
HIS C 183
PHE C 210
ASP C 269
GLY C 306
TYR C 308
SHH C 406
4QA0_A_SHHA404 4qa0 SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
8
PF00850
(Hist_deacetyl)
no annotation
15 TYR A 100
HIS A 142
HIS A 143
GLY A 151
PHE A 152
ASP A 178
HIS A 180
PHE A 208
ASP A 267
PRO B 273
MET A 274
MET B 274
GLY A 304
TYR A 306
TYR B 306
SHH A 404
4QA0_B_SHHB404 4qa0 SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
8
PF00850
(Hist_deacetyl)
no annotation
14 TYR B 100
HIS B 142
HIS B 143
PHE B 152
ASP B 178
HIS B 180
PHE B 208
ASP B 267
PRO A 273
MET A 274
MET B 274
GLY B 304
TYR A 306
TYR B 306
SHH B 404
4QA2_A_SHHA404 4qa2 SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
8
PF00850
(Hist_deacetyl)
no annotation
15 TYR A 100
HIS A 142
HIS A 143
GLY A 151
PHE A 152
ASP A 178
HIS A 180
PHE A 208
ASP A 267
PRO B 273
MET A 274
MET B 274
GLY A 304
TYR A 306
TYR B 306
SHH A 404
4QA2_B_SHHB404 4qa2 SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens HISTONE DEACETYLASE
8
PF00850
(Hist_deacetyl)
no annotation
14 TYR B 100
HIS B 142
HIS B 143
GLY B 151
PHE B 152
ASP B 178
HIS B 180
PHE B 208
ASP B 267
PRO A 273
MET B 274
GLY B 304
TYR A 306
TYR B 306
SHH B 404
4R7L_A_SHHA709 4r7l SHH

DB02546
(Vorinostat)
Homo sapiens LEUKOTRIENE A-4
HYDROLASE
PF01433
(Peptidase_M1)
PF09127
(Leuk-A4-hydro_C)
14 GLN A 136
ALA A 137
TYR A 267
GLU A 271
HIS A 295
GLU A 296
HIS A 299
TRP A 311
PHE A 314
GLU A 318
LEU A 369
PRO A 374
TYR A 378
TYR A 383
SHH A 709