Ligand ID: ABU

Drugbank ID:
Gamma-aminobutyric acid
(DB02530)


Indication:
The most common inhibitory neurotransmitter in the central nervous system.


LIST OF BINDING INTERFACES for query 'DB02530'
(Click on the 'Details' column to view details on interfaces and similar patterns of amino acids)
Click on the 'View' column to view patterns on the structural viewer)

DrReposER ID PDB Ligand Drug Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM View Details
1QUR_I_ABUI481qur ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens;
synthetic construct
BIVALENT INHIBITOR (BZA-2 HIRULOG);
HUMAN THROMBIN (BETA CHAIN)
Trypsin 5GLY I  49
GLY I  50
GLU H 146
THR H 147
GLU H 192
ABU I  48
2OKJ_A_ABUA10012okj ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens GLUTAMATE DECARBOXYLASE 1 Pyridoxal_deC 10ASN A 189
GLN A 190
LEU A 191
SER A 192
ASN B 212
PHE B 214
THR A 348
TYR B 434
LEU B 435
ARG A 567
ABU A1001
2OKK_A_ABUA5852okk ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens GLUTAMATE DECARBOXYLASE 2 Pyridoxal_deC 6ASN A 180
GLN A 181
LEU A 182
SER A 183
THR A 339
ARG A 558
ABU A 585
2OKK_A_ABUA5862okk ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens GLUTAMATE DECARBOXYLASE 2 Pyridoxal_deC 7GLN A 181
LEU A 182
SER A 183
HIS A 282
PHE A 283
THR A 339
HIS A 395
ABU A 586
3IP9_A_ABUA3573ip9 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Agrobacterium tumefaciens ABC TRANSPORTER, SUBSTRATE BINDING PROTEIN (AMINO ACID) Peripla_BP_6 12PHE A  77
ASN A  78
SER A  79
ALA A 100
ALA A 101
THR A 102
ASN A 103
TYR A 150
LEU A 202
ASP A 226
GLY A 227
TYR A 275
ABU A 357
3USU_A_ABUA2803usu ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Butea monosperma LECTIN ALPHA CHAIN;
LECTIN BETA CHAIN
Lectin_legB 12ASN A   3
THR A   4
ASP A   5
ASN D  18
SER A  56
PRO A  57
ILE A  58
ASN A  59
TRP A 208
SER A 236
LYS A 237
LEU A 238
ABU A 280
4ATQ_A_ABUA14574atq ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Arthrobacter aurescens 4-AMINOBUTYRATE TRANSAMINASE Aminotran_3 11ILE A  73
MET B 102
TYR A 161
ARG A 164
TYR A 178
GLU A 238
GLN A 269
LYS A 295
GLY B 322
GLY B 323
THR B 324
ABU A1457
4EUO_A_ABUA4044euo ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Agrobacterium tumefaciens ABC TRANSPORTER, SUBSTRATE BINDING PROTEIN (POLYAMINE) SBP_bac_8 9TRP A  30
THR A  34
GLU A  82
PHE A 121
TYR A 123
TRP A 222
ARG A 225
ASP A 248
TYR A 284
ABU A 404
4I30_A_ABUA3034i30 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Canavalia lineata CONCANAVALIN-A Lectin_legB 12TRP A  88
SER A 113
LYS A 114
LEU A 115
ASN A 124
ALA A 125
LEU A 126
PRO A 178
VAL A 179
HIS A 180
ILE A 181
SER A 190
ABU A 303
4K17_C_ABUC7014k17 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Mus musculus LEUCINE-RICH REPEAT-CONTAINING PROTEIN 16A Carm_PH
LRR_6
7LYS C 222
LYS C 226
VAL C 252
THR C 280
ASN C 282
HIS C 309
ASN C 311
ABU C 701
4M3C_E_ABUE3034m3c ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Butea monosperma;
spatholobus parviflorus
SEED LECTIN ALPHA CHAIN;
SEED LECTIN BETA CHAIN
Lectin_legB 5LEU H  14
TRP E  60
PRO E 205
GLU E 206
TRP E 207
ABU E 303
4MS3_A_ABUA5014ms3 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID TYPE B RECEPTOR SUBUNIT 1 ANF_receptor 12TRP A  65
CYS A 129
SER A 130
GLY A 151
SER A 152
SER A 153
SER A 154
HIS A 170
VAL A 201
TYR A 250
TRP A 278
GLU A 349
ABU A 501
4RLG_D_ABUD5024rlg ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Sphaerobacter thermophilus dsm 20745 PYRIDOXAL-DEPENDENT DECARBOXYLASE Pyridoxal_deC 12ALA D 185
SER D 186
GLU D 187
ALA D 188
ALA D 189
HIS D 190
THR D 191
LEU D 193
GLN D 194
VAL D 207
PRO D 209
TYR C 333
ABU D 502
4RLG_D_ABUD5034rlg ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Sphaerobacter thermophilus dsm 20745 PYRIDOXAL-DEPENDENT DECARBOXYLASE Pyridoxal_deC 7ALA D 189
HIS D 190
THR D 191
LEU D 193
GLN D 194
VAL D 207
TYR C 333
ABU D 503
5LRV_C_ABUC765lrv ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens;
synthetic construct
OTU DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 7B;
POLYUBIQUITIN-B
OTU
ubiquitin
11ARG C  74
GLY C  75
THR A 189
GLY A 190
ASP A 191
GLY A 192
ASN A 193
CYS A 194
SER A 293
ALA A 357
HIS A 358
ABU C  76
5LTV_A_ABUA3015ltv ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Pseudomonas aeruginosa CHEMOTACTIC TRANSDUCER PCTC dCache_1 14SER A 101
TYR A 103
PHE A 112
MET A 114
MET A 120
TYR A 124
ARG A 129
TRP A 131
PHE A 147
VAL A 148
ASP A 149
ALA A 150
ILE A 156
ASP A 176
ABU A 301
5X03_A_ABUA5025x03 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Bacillus subtilis (strain 168) HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN GABR Aminotran_1_2 9HIS A 114
MET A 115
MET B 145
TYR A 205
ARG A 207
PHE A 250
TYR A 281
ARG A 430
PHE A 431
ABU A 502
6A96_B_ABUB5106a96 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Lama glama;
homo sapiens
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-5,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-5;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-3,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-3
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
9ARG A  70
LEU A 121
THR A 133
GLU B 155
SER B 156
TYR B 157
PHE B 200
THR B 202
TYR B 205
ABU B 510
6DW0_B_ABUB4016dw0 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Rattus norvegicus GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
9PHE C  64
ARG C  66
TYR B  97
THR C 129
GLU B 155
SER B 156
TYR B 157
THR B 202
TYR B 205
ABU B 401
6DW0_B_ABUB4076dw0 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Rattus norvegicus GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
8TYR B  62
GLN B  64
PHE A  99
MET B 115
TYR A 159
SER A 204
THR A 206
TYR A 209
ABU B 407
6DW1_C_ABUC4056dw1 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Rattus norvegicus GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-1
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
10PHE C  64
ARG C  66
TYR B  97
THR C 129
GLU B 155
SER B 156
TYR B 157
PHE B 200
THR B 202
TYR B 205
ABU C 405
6EB3_C_ABUC3016eb3 ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Metagenome EST1 NA 9GLY C  27
LEU C  28
SER C  94
MET C  95
MET C  98
THR C 193
LEU C 219
ILE C 220
HIS C 245
ABU C 301
6HUJ_A_ABUA5106huj ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Bos taurus;
homo sapiens;
lama glama
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-3
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
10PHE A  65
ARG A  67
TYR B  97
THR A 130
GLU B 155
SER B 156
TYR B 157
PHE B 200
THR B 202
TYR B 205
ABU A 510
6HUO_E_ABUE5016huo ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Bos taurus;
homo sapiens;
lama glama
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1,GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-3
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
11PHE D  65
ARG D  67
TYR E  97
LEU D 118
THR D 130
GLU E 155
SER E 156
TYR E 157
PHE E 200
THR E 202
TYR E 205
ABU E 501
6JDW_A_ABUA5006jdw ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens PROTEIN (L-ARGININE:GLYCINE AMIDINOTRANSFERASE) NA 15ASP A 170
ASN A 300
MET A 302
HIS A 303
ASP A 305
ALA A 306
THR A 307
ARG A 322
SER A 354
SER A 355
LEU A 358
ASN A 361
GLY A 402
GLY A 403
CYS A 407
ABU A 500
6PLX_A_ABUA5046plx ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Danio rerio GLYCINE RECEPTOR SUBUNIT ALPHAZ1 Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
11PHE E  79
ARG E  81
PHE A 115
LEU E 133
SER E 145
GLU A 173
SER A 174
PHE A 175
TYR A 218
THR A 220
PHE A 223
ABU A 504
6SSI_A_ABUA4016ssi ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Dickeya chrysanthemi;
lama glama
CYS-LOOP LIGAND-GATED ION CHANNEL NA 8ARG B  91
GLU A 131
PRO A 132
PHE A 133
TYR A 175
HIS A 177
LEU A 178
PHE A 188
ABU A 401
6X3T_A_ABUA4056x3t ABUGamma-aminobutyric acid
(DB02530)
Homo sapiens;
mus musculus
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT ALPHA-1;
GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID RECEPTOR SUBUNIT BETA-2
Neur_chan_LBD
Neur_chan_memb
10PHE B  65
ARG B  67
TYR A  97
THR B 130
GLU A 155
SER A 156
TYR A 157
PHE A 200
THR A 202
TYR A 205
ABU A 405
DrReposER ID PDB Ligand Drug Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM View Details